Non è una risposta, ma è troppo lungo per un commento ...

Ho una parola per te in futuro: Moleskine . Taccuini di buona qualità, organizzati in modo tematico o cronologico, sono un ottimo modo per archiviare questo tipo di informazioni. Per le note, la conservazione a lungo termine è un grosso problema e hai poche garanzie che il software X funzionerà ancora sul tuo computer tra 10 o 20 anni. Le soluzioni semplici (sia elettroniche che non) sono le migliori a tale scopo.

Infine, ho gestito le mie note elettronicamente per un po 'di tempo (ho provato molte combinazioni, tra cui iPad / Evernote / Dropbox, file di testo, LaTeX), ma non sono stato soddisfatto per i motivi sopra. Sono tornato al deposito di legno morto (noto anche come carta) con gioia!

Eseguo la scansione delle mie note in PDF e quindi utilizzo LaTeX per aggiungere un sommario personalizzato che aiuta a navigare nel PDF.

Forse vale la pena dare un'occhiata a Qiqqa.

È un sistema di gestione di PDF / riferimenti con un'enfasi particolare (funzionalità nuove e utili, non presenti in altri programmi simili) sulle note e collegamenti tra note sui vari documenti di ricerca.

... e SMETTERE di scrivere note su carta! Scrivi i tuoi appunti sui media digitali e ti renderà la vita molto più semplice, in particolare organizzazione / collegamento / archiviazione / indicizzazione WRT ...

Se sei uno scienziato e vuoi tenere traccia degli appunti, make, anche le soluzioni software di Open Notebook Science potrebbero essere utili.

Non consiglierei EndNote. È cambiato relativamente poco negli anni e negli anni. Molti dei più recenti sistemi di gestione PDF hanno interfacce utente di gran lunga migliori e sono in generale più moderni (e spesso gratuiti!).

Vorrei secondo Evernote. Forniscono un OCR della scrittura a mano davvero eccezionale, la chiave è ricordarsi di scansionare le note come JPG (o convertirle in JPG) poiché Evernote non esegue l'OCR della scrittura a mano nei PDF. Con il loro OCR, non hai nemmeno bisogno di organizzarti nell'app, puoi semplicemente cercare parole chiave per trovare quello che stai cercando. Se stai cercando un modo semplice per caricare le tue note in Evernote e hai un iPhone, ti consiglio vivamente JotNote Scanner Pro.

Uso Endnote, che ti consente di scattare foto delle note e di inserire tag / date / Altre note! sopra.

È molto indipendente dal dispositivo e puoi eseguire tutto il processo di digitalizzazione utilizzando un iPhone o un telefono Android, ovviamente se hai una buona fotocamera, sarà meglio per i problemi di risoluzione.

Esiste un'azienda che esegue l'OCR per la compatibilità delle note di chiusura, ma devi acquistare la sua carta speciale, che è un po 'costosa.

Potresti anche dare un'occhiata a Evernote, che fa un ottimo lavoro nell'organizzare le note. Penso che supporti anche la creazione di immagini con l'app Evernote (Android o iPhone) e il caricamento (ad esempio per un poster in una conferenza). Uso per memorizzare le note digitate dal computer, ma puoi anche caricare e memorizzare note scritte a mano scansionate. Evernote ha un account gratuito con larghezza di banda limitata, quindi a seconda di ciò che desideri questo potrebbe o non potrebbe essere sufficiente.

Dato che hai già scritto le note, sembra che principalmente quello che stai cercando sia un sistema di gestione dei riferimenti digitali, simile ai cataloghi di schede digitali della biblioteca.

Questo ti consentirebbe di cercare nelle tue note una parola chiave o un soggetto e poi sapere che si trova nel taccuino A a pagina 20. Ci sarebbero molti modi per farlo, ma zotero è molto flessibile e dovrebbe essere in grado di soddisfare le tue esigenze.

Anche se questo thread è vecchio, potrebbe essere un'informazione utile. È possibile utilizzare il programma Onenote incluso in MS Office. Cerca di eseguire l'OCR su qualsiasi documento digitalizzato e rilasciato in una pagina Onenote o "stampa" da pdf in una pagina Onenote. Per le note che non possono eseguire l'OCR, puoi aggiungere annotazioni con parole chiave ricercabili. Per separare le pagine di un documento PDF di grandi dimensioni puoi utilizzare un programma come PDFill Free. Non è una soluzione perfetta, ma può comunque essere di grande aiuto per trasformare note scritte a mano in documenti ricercabili elettronicamente.

Li scansionerei e li salverei in evernote. Un'alternativa è che trovi un libero professionista (ad esempio su odesk) che digita i tuoi appunti (il software non è molto bravo a riconoscere la grafia).