Il mio consiglio è di dichiarare fatti e non conclusioni.

Ad esempio, non dovresti dire:

È impossibile finire la mia laurea qui perché discriminano i cristiani.

Invece, potresti dire:

Ho finito tutti i miei corsi, ma non sono riuscito a ottenere un posto un laboratorio - ci sono solo 10 posti di laboratorio per 40 studenti. Inoltre, due diversi professori mi hanno detto che avrebbero dato la priorità agli studenti musulmani (non sono musulmano). Detto questo, la mia migliore opzione sembra essere quella di ricominciare in un'altra università.

A proposito, volevo anche commentare questa riga:

chiedendo la mia motivazione per ricominciare il Master e non correre per un dottorato di ricerca

In alcuni campi e in alcuni paesi, è comune passare direttamente dall'università al dottorato senza ottenere un master. Questo professore potrebbe chiederti specificamente perché vuoi provare di nuovo a ottenere un master, invece di iscriverti direttamente a un programma di dottorato.

Modifica: ispirato dalla risposta di @ arp, amplierò il mio script per la possibile confusione tra master e dottorato

Ho fatto domanda per un master perché lascerò [l'attuale univ] senza un master. Ho finito tutti i miei corsi, ma non sono riuscito a ottenere un posto in un laboratorio - ci sono solo 10 posti di laboratorio per 40 studenti. Inoltre, due diversi professori mi hanno detto che avrebbero dato la priorità agli studenti musulmani (non sono musulmano). Detto questo, la mia migliore opzione sembra essere quella di ricominciare in un'altra università. Sarei certamente aperto a perseguire un dottorato di ricerca presso [new univ] se questa è un'opzione, ma la mia comprensione è che dovrò completare il primo del mio master.

C'è una bella risposta di @ cag51. Se ti senti a tuo agio con questo approccio, fallo.

Nel caso in cui ti senti ancora un po 'nauseato e preferiresti essere un po' più riservato riguardo alla situazione, farò una pugnalata con un approccio più vago:

Ho finito tutti i miei corsi, ma mi sentirei più a mio agio a continuare i miei studi in un ambiente meno irto di tensioni politiche e religiose. Le opportunità di ricerca sono molto limitate nella mia attuale università.

In questo modo non punti il ​​dito e non identifichi la tua religione.

Se è ancora così troppo personale per i tuoi gusti, potresti limitarti al minimo:

Le opportunità di ricerca sono molto limitate nella mia attuale università.

Quanto si vuole divulgare sui tempi difficili che si sono passati è una decisione molto personale.

Ho imparato da Fred Rogers (che ha realizzato il programma televisivo per bambini Mr. Rogers 'Neighbourhood) che nessuno dovrebbe mai sentirsi obbligato a condividere più di uno è una condivisione confortevole.

Ci sono due domande separate qui, e il professore ne ha fatta una, mentre tu rispondi all'altra.

(1) Non stai finendo il programma del tuo Master perché le opportunità di ricerca [per i non musulmani] sono limitate nella tua posizione attuale.

(2) Stai scegliendo di riavviare un programma di Master invece di candidarti direttamente a un programma di dottorato perché i programmi di dottorato diretti non sono comuni nella tua regione e non l'avevi considerato come una delle tue opzioni.

Oppure

(2a) Stai scegliendo di riavviare il programma di Master invece di candidarti direttamente a un programma di dottorato per (qualche motivo accademico).

(Questo answer per lo più combina e affina le risposte precedenti, ma volevo evidenziare la mancata corrispondenza tra la domanda del professore e la tua risposta.)

Menzionalo apertamente, ma cerca di non essere emotivo e di dichiarare semplicemente i fatti sul sistema in cui ti trovi. Essere discriminati nei loro paesi è un problema molto comune tra i ricercatori che vanno a studiare / lavorare all'estero. Aumenta la tua motivazione, quindi è improbabile che venga visto come qualcosa di negativo. Spiegare la tua motivazione è importante per qualcosa con un lungo impegno come master o dottorato di ricerca. Non scrivere troppo in esso a meno che non ti venga chiesto.

Non devi preoccuparti di sembrare "piagnucoloso" in questa situazione. Ti è stato chiesto esplicitamente della tua motivazione per lasciare il tuo attuale programma di Master, quindi è ragionevole che tu sia franco nell'affermare il motivo se ti senti a tuo agio nel farlo. Se fanno la domanda, presumibilmente sono disposti ad ascoltare la risposta.

Il professore ha chiesto perché vuoi ricominciare i tuoi master invece di perseguire un dottorato di ricerca. Dovresti considerare la possibilità che ti permetteranno di seguire un percorso di dottorato direttamente e senza aver completato prima un master. Forse dovresti vedere se questo è possibile e scegliere questa opzione, a condizione che accettino la premessa del motivo per cui il tuo Master non è stato completato.
In una nota relativa alla divulgazione della discriminazione percepita, non vedo alcun problema con la divulgazione, fintanto che il tuo tono non confonde la discriminazione che è un dato di fatto e la discriminazione che si presume. Vivo in un paese in cui i cristiani fanno spesso affermazioni frivole e ovviamente false di essere perseguitati, quando sono la fascia demografica dominante e non sono perseguitati. Ma se vivi in ​​Medio Oriente, un professore in Europa probabilmente crederà prontamente alla tua storia.
Presumo che tu abbia scelto un argomento di tesi valido, abbia tentato di approfondirlo e sia stato respinto. Se premuto, potresti voler dimostrare che l'argomento della tua tesi era valido e che sarebbe stato approvato dall'istituto a cui ti stai candidando. Dico questo solo perché potrebbero esserci persone che non sono riuscite a completare una tesi specificamente perché erano determinate a perseguire un argomento disonesto o senza merito accademico.