Quando scrivi un articolo, il tuo compito non è dimostrare qualcosa. È per comunicare agli altri che lo hai dimostrato. Se fai qualche errore teorico nel tuo articolo, questo è il tuo problema e dovresti correggerlo. Se scrivi un articolo che non comunica abbastanza bene i tuoi risultati e induce in errore i tuoi lettori a false conclusioni, anche questo è un tuo errore ed è tuo compito correggerlo.
E sì, scrivere è difficile. Ci piace annotare la nostra linea di pensiero nel modo che ha più senso per noi, e poi ci aspettiamo che gli altri capiscano. In realtà, un buon giornale adatta la sua scrittura ai lettori. I migliori autori progettano il loro testo come una traccia per il filo dei pensieri del lettore, conoscendo i possibili nodi di incomprensione e allontanando delicatamente il lettore da essi.
L'autore medio, e talvolta anche il miglior autore, non può scrivere un testo perfetto da zero. I lettori fraintenderanno le cose di tanto in tanto. E un revisore è un lettore molto approfondito. Se il tuo revisore fraintende qualcosa nel tuo articolo, allora è probabile che una grande fetta di lettori successivi (che non cercano di seguire il tuo testo da nessuna parte così da vicino) lo fraintenderà allo stesso modo. Questo è un grave difetto nel tuo documento e deve essere risolto. Fortunatamente, tali soluzioni sono molto facili con un po 'di pensiero.
Nel tuo caso, il problema è ovviamente che l'ipotesi che hai fatto non era rilevante nel momento in cui il lettore ha raggiunto la tua dimostrazione. Devi cambiarlo. Ad esempio, nel punto in cui elenchi le tue ipotesi, aggiungi una o due frasi che discutono del motivo per cui l'assunzione è stata fatta e quali sono le sue conseguenze. Costringerà il lettore a pensare al presupposto, a notarlo e a tenerlo a mente per il resto dell'articolo. Se in seguito pensa al suo controesempio, si accorgerà che non è un controesempio, purché sia ovvio quanto ferisca l'assunto. Se non è ovvio, è una buona idea discutere (da qualche parte dopo la dimostrazione) come esempi di questo tipo non siano controesempi, perché c'è una svolta che li fa ferire la tua ipotesi.
Dopo che il paper è stato corretto in questo modo, puoi decidere se ripresentarlo alla stessa rivista (segnala all'editore che si è trattato di un malinteso e che hai apportato modifiche al testo per chiarire il punto ) o in un'altra sede.